Im Rahmen der "Offensive Zukunft Bayern" hatte die Bayerische Staatsregierung 1995 beschlossen, alle zwei Jahre einen Bayerischen Innovationspreis zu verleihen. Der Bayerische Innovationspreis und jeweils bis zu 10 Anerkennungen wurden durch den Bayerischen Ministerpräsident ausgehändigt. Der Preis wurde 1996 erstmals und 2008 letztmals verliehen.